O RISE combina uma análise fundamental de sequenciamento de exoma completo (WES) ou sequenciamento de genoma completo (WGS)* com análise transcriptômica simultânea por sequenciamento de RNA (RNA-seq). Isso pode permitir maior rendimento diagnóstico de casos complexos ou não diagnosticados. A integração de análises centradas em DNA e RNA maximiza a utilidade clínica ao avaliar o impacto no nível de RNA de regiões codificadoras, alterações no local de splicing e variantes em regiões regulatórias não codificadoras de genes alvo fenotipicamente relevantes. 1, 2
*O RISE também está disponível com painéis selecionados de câncer hereditário. Entre em contato conosco para obter detalhes.
Benefícios do RISE
Rendimentos baseados em evidências
Até 36% de rendimento diagnóstico em casos de WES/WGS não diagnosticados anteriormente.
Insights mais claros
Refina a classificação de variantes de DNA e reduz as taxas de VUS.
Análise mais rica
Detecta o impacto da expressão genética de variantes codificadoras e não codificadoras.
Maiores rendimentos diagnósticos
Espera-se que uma abordagem integrada de RNA aumente a taxa geral de diagnóstico em até 52% por meio da detecção de expressão gênica anormal, splicing aberrante ou expressão monoalélica, alterações que não teriam sido sinalizadas apenas pela análise de DNA.
A utilidade clínica por trás do conceito RISE foi relatada em vários tipos de tecidos e condições, particularmente em casos complexos envolvendo distúrbios mitocondriais, musculares e do neurodesenvolvimento.
O RNA-Seq fornece uma análise mais rica do que o WES/WGS sozinho
- Identifica o impacto nos níveis de expressão genética de regiões reguladoras
- Identifica a consequência funcional das variantes do sítio de splicing
- Identifica grandes inserções/deleções e mudanças estruturais complexas
- Confirma variantes estruturais, incluindo duplicações em tandem
- Fornece insights sobre transtornos de impressão, incluindo dissomia uniparental (UPD)
- Determina o status da inativação distorcida do X
- Verifica e distingue variantes de artefatos de sequenciamento e pseudogenes
Especificações de teste
DETALHES DO TESTE
Duo/trio preferido (RNA-seq será executado apenas no probando); singleton aceito
Tempo de resposta do RISE: 5 a 7 dias adicionais a partir do TAT do teste solicitado
- WES (sequenciamento completo do exoma) com RISE: 6 a 8 semanas
- WGS (Sequenciamento do Genoma Completo) com RISE: 8-11 semanas
REQUISITOS DA AMOSTRA
Requer 1 tubo de EDTA (4 mL de sangue total*) e 1 tubo de PAXgene Blood RNA (2,5 mL de sangue total)
*Para pacientes com menos de 1 ano de idade, podemos aceitar 1-2 mL
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Referências
1. Kernohan, KD, Boycott, KM A caixa de ferramentas de diagnóstico em expansão para doenças genéticas raras. Nat Rev Genet (2024).
2. Peymani F, Farzeen A, Prokisch H. Papel e aplicação do sequenciamento de RNA no diagnóstico clínico. Pediatr Investig. 2022;6(1):29-35. Publicado em 5 de março de 2022.
3. Curry, PDK, Broda, KL & Carroll, CJ O papel do sequenciamento de RNA como uma nova ferramenta de diagnóstico genético. Curr Genet Med Rep 9, 13–21 (2021).
4. Gonorazky HD, Naumenko S, Ramani AK, et al. Expanding the Boundaries of RNA Sequencing as a Diagnostic Tool for Rare Mendelian Disease [correção publicada aparece em Am J Hum Genet. 2019 2 de maio;104(5):1007]. Am J Hum Genet. 2019;104(3):466-483.
5. Deelen P, van Dam S, Herkert JC, et al. Melhorando o rendimento diagnóstico do sequenciamento do exoma por meio da previsão de associações gene-fenótipo usando análise de expressão gênica em larga escala. Nat Commun. 2019;10(1):2837. Publicado em 28 de junho de 2019.
